En cuanto a la bandera -tras el estudio también de nuevos documentos-, estuvo presente en el estadio de O’Donnell, y reflejaba los colores del club, blanco y morado. Al año siguiente, surgieron discrepancias con las autoridades de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos, pues el rector José Antonio Encinas prohibió la utilización del nombre -Federación Universitaria de Fútbol- y ello dio lugar al cambio, por «Club Universitario de Deportes», independizándose totalmente de la universidad.