A la pandemia de COVID-19 que afectó al fútbol nacional e internacional (y que mantuvo paralizado el torneo durante varios meses), se sumó un rendimiento muy irregular del equipo, que terminó con la salida de Hernán Caputto y la llegada del DT venezolano Rafael Dudamel. Así, y tras varios vaivenes en cuanto a resultados, finalmente la U terminó en febrero de 2021 sellando su continuidad en la máxima categoría del balompié, e incluso clasificando a primeras fases de Copa Libertadores 2021. Asimismo selló la salida de Matías Rodríguez, Jean Beausejour y Walter Montillo, camiseta del paris quien se retiró de la actividad siendo una de las figuras azules durante la temporada.